"Desteğiniz ve özverili yardımınız için lütfen yüksek performanslı bilgi işlem proje ekibi adına size içten minnettarlığımı ifade etmeme izin verin. Sıradan bir bilimsel araştırmacı olarak, görevimiz araştırmacılara bu koronavirüs tedavi çalışması için ilaç sağlamaktır. Sanal tarama ve moleküler dinamik simülasyon hesaplama ortamı desteği. Bu, Lanzhou Üniversitesi ve Macau Bilim ve Teknoloji Üniversitesi'nden kısa süre önce Şangay Süper Hesaplama Merkezi tarafından alınan bir teşekkür mektubu. Salgın vurduğunda, iki okuldan bilim adamları derhal yoğun aşı araştırma ve geliştirme ve ilaç taramasına yatırım yaptılar. Ancak, okulun bilgi işlem kaynakları yetersizdi ve tereddüt ettiklerinde, yardım için Şangay Süper Bilgisayar Merkezi'ne döndüler. Süper Bilgisayar Merkezi de beklentileri karşıladı.Üç yerin birbirine bağlanması için ortak bir araştırma mekanizması kurmak sadece 6 saat sürdü ve 16 saat içinde topluma çok sayıda ücretsiz CPU ve GPU hesaplama kaynağı sundu.
Zamana karşı yarış, daha hızlı gidelim
30 Ocak akşamı, Lanzhou Üniversitesi'nin bilimsel araştırma ekibi ve Makao Bilim ve Teknoloji Üniversitesi Geleneksel Çin Tıbbı Devlet Anahtar Kalite Araştırma Laboratuvarı, bilgi işlem kaynakları ve teknolojisi sağlamayı umarak Gansu Eyaleti Bilgi İşlem Merkezi (Şanghay Süper Bilgisayar Gansu Şubesi) aracılığıyla Şangay Süper Hesaplama Merkezi ile temasa geçti Yaklaşan daha büyük ölçekli hesaplama simülasyon çalışmalarını karşılama desteği. İki taraf arasındaki iletişimden sonra, en az 1000 çekirdekli CPU, 30'dan fazla invida V100GPU hızlandırılmış işlemci ve 50 TB depolama kaynağı gerektiğini öğrendiler. Bu talepleri aldıktan sonra personel çok gergindi - Bahar Şenliği ve salgın önleme ve kontrol dönemiydi ve personel hemen işe dönemedi. Diğer bir sorun da, Şangay Süper Hesaplama Merkezi'ndeki V100GPU hızlandırılmış işlemcilerin sayısının çok az olması ve genişleyecek olan mevcut ve gelecekteki bilgi işlem ihtiyaçlarını karşılayamayacak olmasıdır.
Zorluklar karşısında, kendi bilgi işlem kaynaklarının bir kısmını tahsis ederken, Şangay Süper Hesaplama Merkezi ayrıca Şangay Süper Hesaplama Merkezi, Şangay Süper Hesaplama Teknolojisi Co., Ltd., Gansu Hesaplama Merkezi ve Suzhou Süper Hesaplama Merkezi'nden oluşan ortak bir çalışma düzenleyip koordine etti ve kurdu. Grup ilk olarak Lanzhou Üniversitesi araştırma ekibine Gansu Bilgi İşlem Merkezi aracılığıyla yerel acil durum bilgi işlem ihtiyaçlarını sağladı.Aynı zamanda, Şangay Süper Bilgisayar HPCplus bilgi işlem platformu aracılığıyla 3000'den fazla çekirdek CPU kaynağını entegre etmek yalnızca 6 saat sürdü. Bunlar arasında, Shanghai Supercomputing 2048 çekirdeği, Gansu Computing Center 1024 çekirdeği ve GPU v100 toplam 32 parçasının tümü Suzhou Supercomputing Center (Shanghai Supercomputing Suzhou Branch) tarafından sağlanmaktadır. Kısa süre sonra, üç bölgeli bir ara bağlantı uygulama platformu kuruldu ve nihayet 31 Ocak'ta araştırma ekibini memnun etmek için CPU ve GPU hesaplama kaynakları sağladı. Bir destek talebini almak yalnızca 16 saat sürdü.
Bilgisayar çalıştırılır ve yardımcı olur
Bilimsel araştırma için gerekli bir araç olarak süper bilgisayarlar gen dizileme, ilaç geliştirme, virüs yapısı analizi vb. Konularda önemli bir rol oynayabilir ve araştırma sürecini hızlandırabilir. Virüs aşıları ve ilaçlarının geliştirilmesinde, virüsün temel yapısının anlaşılması için öncelikle virüsün dizilenmesi gerekmektedir. Şu anda, biyoinformatik karşılaştırma ve arama için çok sayıda bilgi işlem kaynağının kullanılması gerekiyor. Şangay Süper Hesaplama Merkezi'nin ilgili bir personeli şunları söyledi: "Bu salgın karşısında, araştırmacıların virüsün işlevini kaybetmesine neden olmak için virüsle ne tür moleküllerin birleştiğini hala bulmaları gerekiyor. Süper bilgisayar, farklı ilaç molekülleri ve virüs kombinasyonunu simüle ediyor. Moleküler dinamik simülasyonundaki değişiklik bu süreci büyük ölçüde hızlandırabilir.Bu nedenle, gen karşılaştırması, sanal ilaç taraması ve süper bilgisayarlarda hassas moleküler dinamik simülasyon gibi ilgili hesaplamalar, potansiyel olarak etkili ilaçları hızla bulabilir. Yapı, sonraki deneysel aşamada bileşik seçimi ve testi için rehberlik sağlar. "
Süper bilgisayarların gen karşılaştırmasında, ilaç araştırma ve geliştirmede, virüs yapısında vb. Oynayabilecekleri rolü temel alan Şangay Süper Hesaplama Merkezi, salgın durumu anladıktan sonra iç tartışmalara ve ilgili hazırlıklara başladı. Fudan Üniversitesi ve Şangay Jiaotong Üniversitesi gibi çok sayıda gen araştırması ve farmasötik araştırma grubu kendileriyle iletişime geçerek salgınla ilgili bilimsel araştırmaların simülasyonunda karşılaştıkları zorlukları ve ihtiyaçları sordu.
Aşı geliştirme ve ilaç taraması için ücretsiz büyük ölçekli CPU ve GPU kaynakları sağlayın Belki hala aşıları araştırmak ve ilaç taraması yapmak için yirmi dört saat çalışan birçok ekip vardır Hesaplama hızı daha hızlıysa, aşı ve belirli ilaçları yapma zamanı daha hızlı olabilir. Bu amaçla, Şangay Süper Bilgisayar Merkezi direktörü Zhou Ximin, daha önce geçici olarak inşa edilen İnternet paylaşım platformunu tüm topluma ücretsiz olarak açmaya karar verdi. Bu nedenle, Shanghai Supercomputing, Gansu Eyalet Bilgi İşlem Merkezi, Jiangxi Eyalet Bilgi İşlem Merkezi, Suzhou Süper Hesaplama Merkezi ve Kunshan Süper Hesaplama Merkezi ile birlikte, ara bağlantı ve birlikte çalışabilirlik için ortak bir araştırma mekanizması kurdu. 1 Şubat'ta halka büyük ölçekli CPU ve GPU kaynaklarını ücretsiz olarak koordine edeceğini duyurdu. Bilimsel araştırmacıların çoğunluğu için aşı araştırma ve geliştirme, ilaç taraması ve salgınla mücadele ile ilgili diğer araştırma çalışmalarını yürütmek. Şangay Süper Hesaplama Merkezine ek olarak bir "Küp 3" süper bilgisayarının piyasaya sürülmesine ek olarak, Suzhou Süper Bilgisayar Merkezi ve Kunshan Süper Hesaplama Merkezi'nin süper bilgi işlem kaynak destek yeteneklerine sahip yeni inşa edilmiş süper bilgisayar merkezleri olduğu bildirildi. Platform, salgınla mücadeleye yardımcı olabilir.
İpuçları Araştırmacılar, ücretsiz kullanım için başvurmak üzere HPCPlus platformunu ziyaret etmek için aşağıdaki QR kodunu tarayabilir (Platform web sitesi: www.hpcplus.net, başvururken, ilgili araştırma içeriğinin tanıtımına öncelikli koruma verilecektir) veya SSCT resmi WeChat genel hesabını (Kimlik: Shanghai Supercomputing) takip edebilir Teknoloji) bir mesaj bırakın.
Şangay Süper Hesaplama Merkezi, 2000 yılında Şangay'da kurulan ilk yerli yüksek performanslı bilgi işlem kamu hizmeti platformudur. Shanghai Supercomputingin bilgi işlem tesisleri, kuruluşundan bu yana şehrin çevresel izleme ve tahmini (PM2.5), hava durumu tahmini, bölgesel uçak ARJ21, büyük yolcu uçağı C919 ve yurt içi gibi çok sayıda temel bilim, kamu refahı ve endüstri mühendisliği araştırma ve geliştirme çalışmalarını desteklemiştir. Arabalar vs. SARS ve kuş gribi gibi önceki halk sağlığı acil durumlarının ilaç geliştirilmesinde de önemli bir rol oynamıştır. Yazar: Shen marsh Lufthansa Editör: Lichen Yan Editör: Xuqi Min * Wenhui'ye özel makaleler, lütfen kaynağı belirtiniz.
-
- Wuhan Üniversitesi Zhongnan Hastanesinin acil merkezinde bir "geri dönen melek grubu" var
-
- iyi haberler! Shaanxi 9 yaşındaki hasta tedavi edildi ve Tongchuan'daki hastaneden taburcu edildi
-
- Li Qiang, salgın önleme ve kontrol üzerine bilimsel araştırmaları araştırmak için biyomedikal teknoloji şirketlerine gitti.
-
- Yolcu gemisinde 3700 kişinin karantinaya alındığı ikinci gün: Yemek maskeleri odaya teslim edilir ve kabinden çıkarılabilir.
-
- Bebeğe yeni koronavirüs bulaşıp bulaşmadığını nasıl anlarım? Nasıl korunuruz? Burada kuru ürünler
-
- El boyaması Doktorların yüzlerindeki belli belirsiz izler de onların güzel madalyaları.
-
- En güzel "retrograd" a haraç! Kondüktör Xu Wei "şefkatli bir sürücü" oldu
-
- Kümülatif tedavi edilmiş yeni koroner pnömoni vakaları, art arda 4 gün boyunca ölüm vakalarını aşıyor ve teyit edilen vakaların büyüme oranı düşmeye devam ediyor
-
- Şangay "Robot Kolonu" Wuhan'ın ön saflarında savaşıyor. "Beyaz Demir Adam" ın arkasında çaresiz Zhang Jiangmen'den oluşan bir grup var.
-
- İzleyin ve birbirinize yardım edin, sıcaklık ve güç aktarın
-
- Daha fazla resimAvustralya'da yangından sonra hayat yeniden sahnede
-
- Xiaogan, bir günde 424 yeni vaka teşhis etti ve test kapasitesi güçlendirildi
