Dünya çapında 1.000'den fazla yeni koronavirüs belgesini analiz ettik ve bulduk ...
Xinhua Haber Ajansı, Pekin, 17 Mart (Muhabir Peng Qian) Yeni taç pnömonisi salgını küresel olarak yayılıyor. Tıbbi personel klinik cephede "salgınla mücadele" için çok çalışıyor ve bilimsel araştırmacılar da yeni koronavirüs, ilaçlar ve aşılar üzerinde yoğun araştırmalar yapmak için laboratuvarda gece gündüz çalışıyor.
Kağıt yayınlamak, dünyanın her yerinden bilim adamlarının virüslerle ilgili en son araştırma ilerlemelerini paylaşmanın en bilimsel ve titiz yoludur ve zorlukların üstesinden gelmek için dünyanın gücünü toplamak için herkesin en son keşifleri zamanında takip etmesini sağlar.
Peki, yeni koronavirüs hakkındaki küresel bilimsel araştırmanın ilerlemesi nedir? Bu soruyu cevaplamak için Tsinghua Üniversitesi'nden bir ekiple birlikte Aralık 2019'dan bu yana 1.000'den fazla yeni koronavirüs ve salgınla ilgili makale toplayarak veri analizi ve görselleştirme gerçekleştirdik. Bu makaleler çoğunlukla bioRxiv ve medRxiv gibi baskı öncesi platformlardan ve Science, Nature ve The Lancet gibi akademik dergilerden gelmektedir.
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Bu makalelerin başlıklarını ve özetlerini aldık ve araştırma konularını ve sıcak noktaları derinlemesine keşfetmek için doğal dil işleme teknolojisi ve yapay zeka makine öğrenme algoritmalarını kullandık. Sonuçların tümünün akademik makaleler olmasını sağlamak için algoritma haberleri, başyazıları ve yorumları ortadan kaldırmak için kullanılır.
İnceleme süreci hızlandırılır ve makale bir "patlama" olarak yayınlanır
BioRxiv, medRxiv, ChemRxiv ve ChinaXiv'in dört baskı öncesi web sitesini ve Science, Nature ve The Lancet'in ilk üç akademik dergisi tarafından yayınlanan ilgili makaleleri inceleyerek, büyük akademik dergilerin salgın sırasında genel olarak hızlandığını görebiliriz. İnceleme süreci, 651 makale 3 aydan fazla bir sürede yayınlandı. Özellikle Ocak ayına girdikten sonra yayın sayısı ve sıklığı hızla arttı.
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Bu salgında, kağıt baskı web sitesi önemli bir rol oynadı ve yayınlanan makaleler, yayınlanan tüm makalelerin% 80'inden fazlasını oluşturuyordu. Ön baskı, meslektaş değerlendirmesi olmadan gözden geçirilmek üzere halka açık bir platforma yüklenen bir makale taslağı anlamına gelir ve bu, geleneksel dergilerin inceleme sürecini birkaç ay boyunca kaydedebilir.
Amerika Birleşik Devletleri'ndeki Cold Spring Harbor Laboratory Press, bioRxiv ve medRxiv olmak üzere iki büyük biyomedikal baskı web sitesini yönetmektedir. Başkan John Inglis, "Science" dergisine verdiği bir röportajda, iki web sitesinin şu anda her gün yeni taç virüsü ile ilgili yaklaşık 10 makale aldığını söyledi.
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Bilimsel araştırma topluluğundaki yeni veri paylaşımı ve açık işbirliği kültürü, önceden basılmış makalelerin yayınlanmasını da teşvik etti.
2016'daki Zika virüsü salgını sırasında, araştırma sonuçlarının önceden basılı web sitesinde yayınlanması, hakemli dergilerde yayınlanmasını etkileyebilir. Ve bu kez, hakemli dergilerin tümü, araştırma sonuçlarının "benzeri görülmemiş birliği" göstererek ön baskı web sitesinde yayınlanmasını oybirliğiyle destekledi.
Bununla birlikte, makalelerin yayınlanmasını hızlandıracak bir emsal değerlendirme komitesi olmamasına rağmen, önceden basılmış web sitesi aynı zamanda halka zarar verebilecek aceleci bilimsel araştırma sonuçlarının yayınlanmasına da izin verecektir. Daha önce, Hintli bilim adamlarının yeni taç virüsü ile HIV arasındaki ilişki hakkındaki makaleleri, biyoRxiv'in piyasaya sürülmesinden sonra kamuoyunda paniğe neden oldu; bu, makalenin meslektaşları tarafından eleştirildikten sonra geri çekilmesiyle örneklendirildi.
Çinli araştırmacılar en çok katkıda bulundu
Yazarın kurumunun bilgilerine göre, ülkeye özgü istatistikler ve araştırma makalelerinin sıralaması, Çinli araştırmacıların katkıda bulunduğu makale sayısının toplam 412 makale ile en büyük olduğunu gösteriyor; onu Amerika Birleşik Devletleri (223) ve Birleşik Krallık (67 Nesne).
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Çinli araştırmacılar, viral gen dizileri sağlayarak ve tanı ve tedavi planlarını paylaşarak, yeni koronavirüs ile ilgili bilimsel araştırma sonuçlarının hızlı bir şekilde yinelenmesini teşvik eden uluslararası bilimsel araştırma işbirliklerine aktif olarak katıldılar.
Imperial College of Medicine School of Medicine'de yeni taç virüs aşısının araştırma ve geliştirmesine katılan profesör Robin Shattock, "Çinli bilim adamları yeni taç virüsün genom sekans bilgilerinin ifşa edilmesinden çok faydalandı. Bu bizim ve diğer ekiplerin mümkün olan en kısa sürede aşı geliştirmesine yardımcı olacak. Çinli bilimsel araştırmacılar ve sağlık personeli, daha derin bir işbirliği ilişkisi kurmayı umarak iletişim halinde. "
Tsinghua Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Dekanı Profesör Ding Sheng, 2003 SARS salgını ile karşılaştırıldığında Çin'in teknoloji seviyesi, araçları ve Ar-Ge hızının niteliksel olarak arttığını söyledi. "Çinli bilimsel araştırmacılar, virüs türlerini hızla izole ettiler ve genel teknik seviyenin iyileştirilmesiyle desteklenen genetik sıralama gerçekleştirdiler. Şimdi en yüksek seviyemiz dünyanın ön saflarına ulaştı ve herkes aynı yükseklikte bir diyalog kurabilir."
Virüs bilinci derinleşiyor
Araştırma konularının analizi yoluyla, araştırmacıların araştırma odağının esas olarak aşılar, antikorlar ve virüs mekanizmaları gibi temel yaşam bilimi araştırmalarının yanı sıra klinik tanı ve tedavi ve epidemiyolojik araştırmalar olduğu görülebilir.
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Bunlar arasında, virüsün kendisi üzerine yapılan araştırmalar en büyük oranı oluşturuyor. Zaman ilerledikçe, bilimsel araştırmacılar "virüs hakkında daha fazla bilgi sahibi olurlar."
7 Ocak'ta Çinli araştırmacılar, yeni koronavirüsü örneklerden izole ederek virüsün tüm genom dizisini tespit etti ve tüm bilgileri zamanında dünyaya açıkladı. Ocak ayının sonlarından bu yana, anjiyotensin dönüştürücü enzim 2 (ACE2) ve başak protein, araştırmanın odak noktası haline geldi.
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Araştırmacılar, yeni koronavirüsün insan vücudunu, esas olarak virüs yüzeyindeki dikenli protein artışının insan ACE2 reseptörüne bağlanması yoluyla enfekte ettiğini buldu. Spike proteini bir "anahtar" gibidir ve hücredeki ACE2 reseptörü bir "kilit" gibidir. Yalnızca anahtar kilidi açtığında virüs hücreye girebilir. Bu keşif, yeni taç aşılarının ve ilaçlarının geliştirilmesine yardımcı olur.
Epidemiyoloji alanında, "insandan insana geçiş" (insandan insana geçiş) hakkındaki makaleler ilk olarak 20 Ocak civarında yayınlandı. Hemen ardından antikor ve aşı gibi tedavi edici ilaçlarla ilgili araştırmalar artmaya başladı. Araştırmacılar, monoklonal antikorlara, peptit aşılarına ve antiviral ilaçlar olan Ritonavir'e daha fazla önem veriyor.
Tsinghua Üniversitesi AMiner ekibinden bir fotoğraf
Ayrıca Şubat ortasından bu yana tespit yöntemi (rt-PCR) daha fazla ilgi gördü.
Test durumlarındaki artış, test yöntemlerinin "yanlışlık" sorununu ortaya çıkarmıştır ve birçok "yanlış pozitif" ve "yanlış negatif" fenomeni olmuştur. Yeni koronavirüs nükleik asit tespit kiti, esas olarak nazofaringeal sürüntüler, kan ve alveolar lavaj sıvısından alınan örneklerdeki viral genetik materyal içeriğini tespit etmek için floresan PCR teknolojisini kullanır. Nükleik asit içeriği belirli bir eşiği aşarsa, bu pozitif bir sonuçtur ve olduğu kabul edilir Enfekte; belirli bir eşiğin altında, negatif bir sonuç enfekte edilmemiş olarak kabul edilir.
Araştırmacılar, numunenin virüs içeriğinin ve kitin teknik sorunlarının "yanlış ölçümlere" neden olabileceğine inanıyor. Aynı zamanda, yeni koronavirüs bir alt solunum yolu virüsüdür ve nazofaringeal sürüntülerin örnekleme yönteminde de "yanlış negatiflere" yatkın olan hatalı örnekleme gibi sorunlar vardır.
Yeni taç pnömonisi salgını yakın zamanda meydana geldi ve kağıt verilerinin miktarı nispeten sınırlı ve araştırma sonuçları sürekli olarak güncelleniyor. 1.000'den fazla makalenin veri analizi yoluyla, bazı trend yargılarında bulunmak zordur ve küresel bilimsel araştırmanın tüm resmini tanımlamak imkansızdır. Bununla birlikte, analiz yoluyla, dünyanın dört bir yanındaki bilim adamlarının dayanışmasını ve aralıksız çabalarını çok sezgisel olarak görebiliyoruz.
Umarım insanlığın ortak düşmanı olan virüsü bir an önce yeneriz! (Grafik analizi: Peng Qian; Veri Madenciliği ve Görselleştirme: Tsinghua Üniversitesi Aminer Ekibi; Bilimsel Danışman: Doktor Zhou Panpan, Tsinghua Üniversitesi Tıp Fakültesi; Editörler: Tang Zhiqiang, Jin Zheng)
