Bilim adamları, 14.000 yıl önce kurtların RNA'sını başarıyla sıraladı
Mükemmel önlemlerle DNA (deoksiribonükleik asit) binlerce yıl boyunca korunabilir, bu nedenle bilim adamları onu eski Mısırlıların, İngiliz atalarının ve erken insan atalarının genomlarını incelemek için kullanırlar. RNA (ribonükleik asit) çok daha hızlı bozulur, bu nedenle onu eski örneklerde bulmak zordur.
Ancak araştırmacılar bunu, Sibirya donmuş toprakta donmuş 14.000 yaşındaki bir kurdun RNA'sını izole edip sıralayarak yaptılar.
DNA, organizmada genetik bilginin uzun süre saklandığı yerdir.Bilim adamları, onu geleneksel optik diskleri ve manyetik sürücüleri çok aşabilen bir veri depolama sistemi olarak inceliyorlar. Ancak RNA, genlerin "çalışan bir kopyasıdır", bu nedenle varoluş süresi çok kısadır, hatta belki 2 dakika kadar kısadır. Bu nedenle, bilim adamları daha önce eski sistemlerden RNA "transkriptomlarını" çıkarmanın neredeyse imkansız olduğuna inanıyorlardı.
Ancak daha önce istisnalar vardı. Daha önce dizilenebilen ve doğrulanabilen en eski RNA, 700 yıl önceki mısırdır ve geri kazanılmış ancak dizilenemeyen en eski RNA, 5000 yıllık bir Tyrolean buz adamından gelmektedir. Ve şimdi Kopenhag Üniversitesi, Tübingen Üniversitesi, Kuzeydoğu Federal Üniversitesi ve Belçika Kraliyet Doğa Bilimleri Enstitüsü'nden araştırmacılar daha da eski bir örnek keşfettiler.
Bu örnek, yaklaşık 14.300 yıl öncesine dayanan, Pleistosen döneminden bir kurt veya köpeğin mumyalanmış kalıntıları olan Tumat Puppy lakaplı bir örnekten geliyor. Ekip, hayvan karaciğer dokularından çıkarılan RNA'yı izole edip analiz etti ve 19. ve 20. yüzyıllardan daha yeni iki kurt örneğinden alınan dokularla karşılaştırdı.
Ekip, yaşlı bir hayvanın RNA'sını başarıyla sıraladı ve daha modern bir kurttan karaciğere özgü bir transkript ile eşleştirerek organizmanın tüm RNA'sını temsil ettiğini doğruladı. Bu, bunu şimdiye kadarki en eski transkriptom dizilemesi yapar, en az 13.000 yaşında.
Makalenin ilk yazarı Oliver Smith şunları söyledi:
Antik DNA araştırmacıları, daha önce antik RNA'yı sıralamayı denemekte isteksizdi çünkü genellikle DNA'dan daha kararsız ve enzimatik bozulmaya daha yatkındır. Bununla birlikte, yakın zamanda bitki materyallerinden antik RNA'yı başarılı bir şekilde sıraladıktan sonra, permafrostta dondurulmuş iyi korunmuş hayvan örneklerinin de sıralama için yeterli materyali tutabileceğini tahmin ettik. Memnuniyetle, sadece çeşitli dokulardan RNA bulmadığımızı, aynı zamanda dokuları biyolojik olarak anlamlı bir şekilde ayırt edebildiğimizi gördük.
Bu makale "PLOS Biology" de yayınlandı.
