Stalin hafifçe iki sayımı açıkladı ve Zhukov, büyük askeri istismarlarına rağmen hala uçurum gibi bir rütbe indirimi yaşadı.
1939'da Nomonkan Muharebesi'nde 43 yaşındaki Zhukov ilk kez sahneye çıktı ve üstün komuta becerilerini sergilemekle kalmadı, aynı zamanda gerçek savaşta "tank konsantrasyonu" teorisini de doğruladı. Moskova'da zafer kazandığında, Zhukov tüm ülke tarafından övüldü ve "Sovyetler Birliği Kahramanı" ünvanı ile ödüllendirildi.
Yaklaşan savaşa hazırlık olarak, Mayıs 1940'ta Stalin, Zhukov'u önceden generalliğe terfi ettirdi ve ardından onu Kiev Özel Askeri Bölgesi'nin komutanı olarak o sırada Sovyetler Birliği'nin en büyük askeri bölgesinin sorumlusu olarak atadı. 1941'in başında, giderek gerginleşen durumda, Zhukov, Sovyet Ordusu Komutanlığı görevini üstlendi.
22 Haziran'da Sovyet-Alman Savaşı patlak verdi.Alman Üç Yollu Ordusu, geniş Sovyet topraklarında tüm yolu koşarak, birkaç hafta içinde yüzlerce kilometre hinterlanda ilerledi. Temmuz ortasında, Güney Yolu'nun Alman askerleri doğrudan Kiev'i işaret ettiler, Timoşenko'nun Batı Cephesinden gelen zayıf direncini az önce kınadılar.Şu anda Stalin tekrar kızdı ve Güneybatı Cephesi'ne Kiev'i sıkı bir şekilde savunmasını emretti.
Genelkurmay başkanı olarak Zhukov, Alman ordusu tarafından kuşatılmamak için Kiev'i terk etmeyi ve karşı saldırı girişiminde bulunmadan önce güçten tasarruf etmeyi önerdi. Bu bakımdan Stalin öfkeliydi: saçmalık! Kyiv'i düşmana ver ve senin için bir kayıp olarak ortaya çık! "Zhukov nedenlerden dolayı tartıştı: Genelkurmay başkanı olarak benim sadece saçma konuşabileceğimi düşünüyorsanız, lütfen beni kovun!"
Bu şekilde Stalin, Zhukov'u görevinden aldı ve onu yedek cephenin komutanlığına indirdi. Eylül ortasında, 660.000 Sovyet askeri Kiev'de Alman birlikleri tarafından kuşatıldı, Stalin pişman oldu ama artık çok geçti.
Yedek takıma indirildikten sonra, Zhukov depresyona girmedi ve hemen Smolensk savaşına daldı ve Yelnya Bulge'yi yeniden ele geçirmek için savaşı kazandı ve Smolensk savaşında tek Sovyet zaferi oldu. Stalin çok memnundu, özel olarak Zhukov'u çağırdı ve onu Leningrad'da Alman ordusu tarafından tuzağa düşürülen "ateşle savaşmaya" gönderdi.
Ekim ayında "Tayfun Operasyonu" şiddetli bir şekilde geldi.Moskova savaşının kritik kesişme noktasında, Stalin yeniden Zhukov'u düşündü ve acilen Leningrad'da savaşmakta olanı hatırladı. O zamandan beri Zhukov, Moskova savaşının komutasına, Stalingrad savaşına, Kursk savaşına ve Berlin'i fethetmek için son savaşa katıldı ve Stalin'in tehlikeleri ve felaketleri ortadan kaldırmada sadık "itfaiyeci" oldu.
II.Dünya Savaşı'nda Sovyetler Birliği toplam 17 Zafer Madalyası, 5'i Montgomery gibi yabancı generallere, kalan 12'si 10 Sovyet generaline, sadece Stalin ve Zhukov 2'şer madalya aldı.
Zhukov, Eisenhower'a madalyayı verdiğinde, Amerikalı general şakayla: "Umarım bir" Zhukov Madalyası alırım! "Bunu duyduktan sonra Stalin ne düşündü? Eisenhower kesinlikle pek düşünmedi. Bu şaka aynı zamanda Zhukov'un da canını sıktı.
24 Haziran 1945'te Sovyetler Birliği, Vatanseverlik Savaşı'nda büyük bir zafer geçidi düzenledi. Birkaç gün önce ata binerken düşme nedeniyle Stalin, askeri geçit töreninin başı olarak Zhukov'a en yüksek onuru verdi. bu kadar," Başkomutan yardımcısı Zhukov, Kızıl Meydan'da yankılanan Sovyet Kızıl Ordusu'nun "Ula" sesini hayranlık uyandıran Arap beyaz atına bindi ve hayatının zirvesine adım attı.
Resmi askeri geçit töreninden önce Stalin tüm komutanlarla bir grup fotoğrafı çekecekti. Bu sırada asistan, Stalin'den çağrıya cepheden cevap vermesini istedi. Bu "aylaklıktan" yararlanarak Zhukov, Pravda'dan bir muhabiri çağırdı ve kendisinin ve komutanlarının fotoğrafını çekmesini istedi. Ertesi gün Yüksek Komutanın olmadığı bu fotoğraf Pravda'da yayınlandı.
Bundan sonra Zhukov'un kötü şansı devam etti. Haziran 1946'da bir askeri komite toplantısında Zhukov her taraftan ciddi şekilde eleştirildi. Stalin alaycı bir şekilde şunları söyledi: "Bütün büyük Rus komutanlar çok alçakgönüllüler, ama bu nitelikten yoksun. Bak, başka bir Napolyon var ve bir kişi savaş kazandı."
Ardından Stalin, Zhukov'u ilan eden bir emir imzaladı " Artık mütevazı değil ve aynı zamanda her zaman savaşta zaferin belirleyici rolünü kendine atfediyor ".
Bu şekilde, Sovyet Ordusunun başkomutanı olan Zhukov, indirilerek Odessa Askeri Bölgesine atandı ve ardından yedi yıl sonra Stalin'in ölümüne kadar ücra Ural Askeri Bölgesine indirildi.
