Guan Yi'nin yeni kanıtı yine pangolin'e işaret ediyor! Yeni koronavirüs ile amino asit benzerliği% 97.4'e ulaştı
Bu, yeni koronavirüsün potansiyel ara konağının pangolinlere yöneltildiği ilk olay değil!
7 Şubat 2020'de Güney Çin Tarım Üniversitesi, yeni koronavirüs pnömoni salgınının araştırılması ve geliştirilmesi hakkında bir basın toplantısı düzenledi. Güney Çin Tarım Üniversitesi, Lingnan Modern Tarım Bilimi ve Teknolojisi Guangdong Laboratuvarı Profesörü Shen Yongyi, Xiao Lihua ve diğer araştırmacılar toplantıda pangolinin yeni koroner pnömoni için potansiyel bir ara ev sahibi olabileceğini söyledi.
Son zamanlarda, en iyi virolog Guan Yi'nin önderlik ettiği araştırma, pangolin'in ara konakçı olduğunun bir başka güçlü kanıtı oldu. 18 Şubat 2020'de, Hong Kong Üniversitesi'nden Guan Yi ekibi ve Guangxi Tıp Üniversitesi Yanling Hu'nun ekibi "Güney Çin Malay'ı "Güney Çin'deki Malaya pangolinlerinde 2019-nCoV ile ilgili koronavirüslerin tanımlanması" (Güney Çin'deki Malaya pangolinlerinde 2019-nCoV ile ilgili koronavirüslerin belirlenmesi) konulu makale bioRxiv baskı öncesi web sitesinde yayınlandı.
[Resim kaynağı: bioRxiv sahibi: bioRxiv]
Üç parti pangolin numunesinin analizi ve araştırılması
Aslında, tüm memeliler arasında en çok pangolinler yasadışı olarak kaçakçılığı yapılır. Hem gıda kaynağı olarak hem de geleneksel Çin tıbbında kullanılırlar. IUCN'nin Tehdit Altındaki Türlerin Kırmızı Listesi'nde pek çok pangolin türü kritik tehlike altında kabul ediliyor. Bu nedenle, Guan Yi'nin ekibi kaçak pangolini araştırdı.
Özellikle, araştırma ekibi üç grup pangolin örneğini analiz etti ve inceledi (örnekler ayrıca pangolin "tıbbi materyalleri" de içerir).
Her şeyden önce Ekip, Ağustos 2017'den Ocak 2018'e kadar kaçakçılıkla mücadele operasyonlarında Guangxi Gümrüğü tarafından ele geçirilen 18 donmuş pangolin (akciğerler, bağırsaklar, kan) dahil 43 doku örneği topladı.
RNA yüksek verimli sıralama, 43 numuneden 6'sında koronavirüs olduğunu ortaya çıkardı: 2'si akciğerlerde, 2'si bağırsaklarda, 1'i akciğer-bağırsak karışımında ve 1'i kanda.
Karma bağırsak-akciğer örnekleri kullanılarak, Vero-E6 hücre hattı kullanılarak yeni bir B koronavirüs cinsinin izole edilebileceği bildirildi.
Aynı zamanda, dizi okuma verilerini kullanarak ve boşluğu amplikon dizileme ile dolduran ekip, filogenetik analizde GX / P1E, GX / P2V, GX / P3B olarak adlandırılan 6 tam veya neredeyse tam genom dizisi elde etti. , GX / P4L, GX / P5E ve GX / P5L - 2019-Ncov soyuna aittir (Şekil A). Bu virüsler, 2019-Ncov'a benzer bir genom organizasyonuna sahiptir ve 9 tahmini açık okuma çerçevesi vardır (Şekil B).
sonra Araştırma ekibi, Mayıs-Temmuz 2018 arasında bir grup pangolin numunesi üzerinde daha fazla qPCR testi gerçekleştirdi ve 12 pangolinin 19 numunesi (9 bağırsak dokusu ve 10 akciğer dokusu) arasında, 3 akciğer dokusu numunesinin koroner olduğunu buldu. Virüs pozitif. Bu nedenle, iki grup pangolin örneğindeki koronavirüsler aynıdır.
Sonunda Guan Yinin ekibi Guangzhou Gümrük Teknoloji Merkezi ile temasa geçti ve merkez, Mart 2019daki kaçakçılıkla mücadele operasyonu sırasında ele geçirdikleri arşivlenmiş 5 pangolin örneğini (2 deri çubuğu, 1 bilinmeyen doku ve 1 ölçek dahil) yeniden test etti. Bu örneklerde koronavirüs de bulundu.
Örnekteki koronavirüs, yeni koronavirüsün iki alt türüne ait
Buna dayanarak, araştırma ekibi, tam uzunluktaki viral genomun% 86.3'ünü oluşturan kısmi bir genom dizisi oluşturdu ve ardından pangolin örneğinde bulunan koronavirüs genomunun bu sefer yeni koronavirüs (SARS-CoV-2) genomuna benzer olduğunu buldu. % 85.5 -% 92.4 yeni koronavirüsün iki alt tipine aittir. Reseptör bağlanma alanlarından biri (GD / P1L ve GD / P2S) yeni koronavirüs ile yakından ilgilidir.
Lei Feng.com, yeni koronavirüsün -koronavirüs cinsinin Sarbecovirus alt cinsine ait olduğunu öğrenirken, Sarbecovirus alt cinsinin önceki üyelerinin kapsamlı genetik rekombinasyona uğradığını öğrendi.
Guan Yi'nin ekibi tarafından yapılan daha fazla analiz, yarasa koronavirüsü ZC45 ve ZCS21'in birden fazla SARS-CoV ile ilişkili soy (genomik bölgeler 2, 5, 7) ve yeni koronavirüsle ilgili soylar (bu pangolinde bulunan virüs soyu dahil) genomu içerdiğini gösterdi. Parçalar (alan 1, 3, 4, 6, 8).
Ve daha da önemlisi, ekip pangolin koronavirüsü, yarasa koronavirüsü RaTG13 ve yeni koronavirüs arasında spekülatif rekombinasyon sinyalleri gözlemledi.Özellikle, yeni koronavirüsün reseptör bağlanma alanı ile Guangdong pangolin koronavirüsünün amino asit sekansı benzerliği% 97,4'e kadar yüksek. . Yeni koronavirüs, viral genomun geri kalanında en çok yarasa koronavirüsü ile ilişkili olsa da, yarasa koronavirüsü RaTG ve reseptör bağlanma alanı arasındaki amino asit benzerliği sadece% 89,2'dir.
Aynı zamanda, amino asitleri paylaşma açısından Guangdong pangolin koronavirüsü ve yeni koronavirüs, virüs reseptör bölgesinde (aşağıdaki şekilde kırmızı kutu) 5 anahtar kalıntıda amino asit paylaşırken, yarasa koronavirüsü yeni koronavirüs ile sadece bir amino asidi paylaşıyor.
Ayrıca filogenetik analiz, Guangdong pangolin koronavirüsünün yeni koronavirüsün en yakın ilişkisi olmadığını gösteriyor.
Bu nedenle, şu anda kesin bir sonuca varılamasa da araştırma ekibi, Guangdong pangolin koronavirüsü ve yeni koronavirüs arasındaki amino asit benzerliğinin yakınsak evrimden kaynaklanabileceğini ve rekombinasyondan kaynaklanmayabileceğini tahmin ediyor.Bu ayrıca ara hayvan konağın insanlara göre olduğunu kanıtlıyor. Virüslerin ortaya çıkmasının oynadığı rol (bu aynı zamanda önceki "insan yapımı virüsler" komplo teorisini de kırdı).
Yeni koronavirüs tarafından enfekte olmuş yarasalar dışında tek memeli
Lei Feng.com, pangolinlerin, yeni koronavirüs tarafından enfekte olan yarasalar dışında tek memeliler olduğunu öğrendi. Pangolinlerde iki koronavirüs soyu bulundu ve koronavirüs soylarının tümü yeni koronavirüsle ilişkili, bu da doğal olarak pangolinlerin muhtemelen yeni koronavirüsün uzun vadeli konağı olduğunu gösteriyor.
Ancak kağıt aynı zamanda başka bir olasılığa da değindi - pangolinlerin yarasalardan veya diğer hayvan konakçılarından bağımsız olduğu ve yeni koronavirüsle ilgili virüsler edindiği. Bu çıkarım aynı zamanda büyük ölçüde pangolinlerin kaynağıyla da ilgilidir - yukarıda bahsedilen pangolin örneklerinin çoğu Güneydoğu Asya'dan gelir ve pangolinler tarafından taşınan virüs çeşitliliğinin gizemli olduğu söylenebilir.
Aslında araştırma ekibinin vurguladığı gibi:
Yeni koronavirüs ile ilgili virüsler de dahil olmak üzere koronavirüsler, Asya'daki birçok vahşi memelide açıkça mevcuttur.
Bu nedenle, pangolin ile bulaşan virüslerin epidemiyolojisi, patojenitesi, türler arası bulaşıcılığı ve bulaşması için daha fazla araştırma ve incelemeye ihtiyaç vardır. Ancak bu çalışmanın, yeni koronavirüsün ara konağının araştırılmasının yönüne bir kez daha işaret ettiği yadsınamaz.
Guan Yi hakkında
Bu makalenin ilgili yazarlarından biri Guan Yi'dir.
[Lei Feng Net Notu: Guan Yi ve ekibi, Baidu Ansiklopedisi'nden alınmıştır]
Aslında Guan Yi, Hong Kong Üniversitesi Yu Sogo Vakfı Profesörlüğü (Viroloji), Hong Kong Üniversitesi Yeni Ortaya Çıkan Bulaşıcı Hastalıklar Ulusal Anahtar Laboratuvarı, Yeni Gelişen Toksik Hastalıklar Başkanı Profesör olan Royal College of Medicine'den yabancı bir akademisyen olan Guan Yi tıbbi mikrobiyoloji uzmanıdır. Direktör, Hong Kong Üniversitesi Grip Araştırma Merkezi Direktörü, Shantou Üniversitesi-Hong Kong Üniversitesi Ortak Viroloji Enstitüsü Direktörü ve Guangdong-Hong Kong Ortak Gelişen Bulaşıcı Hastalıklar Laboratuvarı Direktörü.
2003 yılında, Guan Yi'nin ekibi SARS virüsünü ilk izole eden ekipti ve misk kedisinin SARS'ın ara konağı ve SARS ile insan enfeksiyonunun doğrudan kaynağı olduğunu doğruladı. Bundan sonra, o ve Akademisyen Zhong Nanshan, Guangdong'un misk kedisini piyasadan kaldırmaya başladığını ve etkili bir şekilde içerdiğini bildirdi. SARS salgını.
Guan Yi, Akademisyen Li Lanjuan, Akademisyen Gao Fu, Profesör Yuan Guoyong ve diğerleri, "H7N9 kuş gribi ile insan enfeksiyonunun önlenmesi ve kontrolünün temsil ettiği yeni bulaşıcı hastalık önleme ve kontrol sistemi" nedeniyle 2017 yılında Guan Yi, Akademisyen Li Lanjuan, Akademisyen Gao Fu, Profesör Yuan Guoyong ve diğerleri yıllık ulusal bilim ve teknolojiyi kazandı. İlerleme Büyük Ödülü.
Guan Yi, 2020'deki bu şiddetli salgının başlangıcında (15 Ocak) bir röportajda şunları söyledi:
Koronavirüsün en uzun kuluçka süresi 15 gündür. 3 Ocak'tan bu yana Ana Karada yeni enfeksiyon vakası görülmedi.Salgının kontrol altına alındığı sonucuna varılabilir. Mevcut bakış açısına göre hastanın semptomları şiddetli değildir, kişiden kişiye bulaşsa bile çok sınırlıdır. Enfeksiyonun kaynağı belli ve salgın kontrol altında Zaferin şafağını şimdiden görebiliyoruz ve insanların güzel bir yıl geçirebileceğine inanıyoruz.
Ancak 23 Ocak 2020'de Guan Yi, Caixin.com ile yaptığı röportajda şunları söyledi:
İhtiyatlı olarak, bu enfeksiyonun ölçeğinin sonunda SARS'ın 10 katı olabileceği tahmin edilmektedir. Çok şey yaşadım, hiç korkmadım, çoğu kontrol edilebilir, ama bu sefer korkuyorum.
Bu açıklama ortaya çıkar çıkmaz Guan Yi'yi eleştiren - eleştiri ve suçlamadan kişisel saldırı ve istismara kadar - ezici sesler yükseldi.
Ancak, Guan Yi'nin önderliğindeki gazete çıkar çıkmaz kanıtlıyor gibiydi: Bu sefer korkmadım.
Referans malzemeleri:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1.full.pdf
