Son araştırmalar, köpeklerin de ara konakçı olabileceğini gösteriyor! Uzmanlar kanıt olmadığını söylüyor!
Yeni bir çalışma, 2020'deki yeni koronavirüsün yarasalarda ortaya çıkmış olabileceğini, ancak patojenin insanlara bulaşmadan önce köpeklere yayılmış olabileceğini gösteriyor. bu gerçek mi? Virüs ara ev sahibi için yeni "adaylar" olacak mı? Köpekler ve pangolinler haklı mı?
Aslında, ancak herkes bu spekülasyona katılmıyor. Bir uzman, çalışmanın "birçok eksikliğine" sahip olduğunu ve verilerin çalışmanın sonuçlarını desteklemediğini söyledi.
Virüslerin evrimi
Yeni koronavirüs SARS-CoV-2 insanlara sıçramadan önce, diğer iki koronavirüs, SARS-CoV ve MERS-CoV yarasalarda evrimleşti ve insanlara giderken diğer hayvanların yanına "yerleşti". SARS-CoV misk kedilerinden, MERS-CoV develerden geçer ve SARS-CoV-2'nin moleküler yapısı, virüsün de bir ara hayvandan geçtiğini gösterir, ancak bilim adamları hangisinin olduğunu bilmiyor.
Bu yılın Şubat ayında, bir ön çalışmanın yazarı, pangolinlerin yarasalar ve insanlar arasında bir iletim "köprüsü" olabileceğini öne sürdü, çünkü pangolinleri ve ilgili koronavirüsleri enfekte eden SARS-CoV-2, virüsün yüzeyinde benzer başak proteinlere sahip. Hücrelere bulaşmasına izin veren bir yapı. Ancak raporlara göre, diğer bilim adamları, pangolin koronavirüslerinin başak proteinlerine sahip olmasına rağmen, SARS-CoV-2'den pek çok farklılığa sahip olduklarına inanıyorlar, bu da pangolinleri bir enfeksiyon kaynağı olma ihtimalini ortadan kaldırıyor.
Gizem henüz çözülmediğinden, Kanada'daki Ottawa Üniversitesi'nde biyoloji profesörü olan Xuhua Xia, koronavirüsün yaralardan insanlara nasıl yayıldığına dair kendi araştırmasını başlattı. Analizi yeni bir çözüm sağladı: köpek.
Xia, bileşik sitozin (C) ve bileşik guaninden (G) oluşan bir gen kodlama dizisi olan CpG lokusu adı verilen özel bir özellik bulmak için SARS-CoV-2 ve diğer koronavirüslerin gen kodlarını taradı. . İnsan bağışıklık sistemi, CpG bölgesini istilacı bir virüsün varlığını gösteren bir işaret noktası olarak görür. Çinko parmak antiviral proteini (ZAP) adı verilen bir insan proteininin, viral gen tarafından kodlanan CpG bölgesine bağlandığı ve insanların patojenleri parçalamasına yardımcı olduğu anlaşılmaktadır. Teori, CpG sitesi ne kadar azsa, virüsün ZAP'ye o kadar az saldırmasıdır.
Xia, SARS-CoV-2'nin diğer bilinen koronavirüslerden (SARS-CoV ve MERS-CoV dahil) daha az CpG sahası taşıdığını buldu. Ek olarak, analize göre, SARS-CoV-2'ye en yakın bilinen yarasa koronavirüsü RaTG13, ilgili yarasa koronavirüsünden daha az CpG bölgesi içeriyor. "Bu, SARS-CoV-2'nin, CpG sitelerinden kurtulmak için virüs üzerinde evrimsel baskı uygulayacak yüksek ZAP ekspresyon yeteneğine sahip yeni bir konakçıda (veya yeni bir konakçı dokuda) evrimleşmiş olabileceğini gösteriyor.
Esasen, hayatta kalmak ve çoğalmak için, SARS-CoV-2 gibi patojenlerin, konakçıdan kaçabilecek bağışıklık savaşçılarına ihtiyacı vardır.Bu durumda, bu, ZAP proteinine virüse yanıt vermesini hatırlatan CpG alanlarının kaldırılması anlamına gelir. .
Köpeğin bağırsaklarından mı?
Ne yazık ki, farklı hayvan dokularında meydana gelen tam ZAP miktarı hakkında çok az veri vardır. Bu yüzden düşük CpG seviyelerine sahip hayvan koronavirüslerini aramaya başladı. Esas olarak köpeklerin bağırsaklarını enfekte eden bir koronavirüs keşfetti ve buradan köpeklerin bağırsaklarının virüsün bu şekilde evrimini teşvik etmek için yeterli ZAP seviyeleri içerebileceği sonucuna vardı.
Xia, Araştırmamda, sadece köpeklerin dokuları düşük CpG-cov üretiyor gibi görünüyor dedi. SARS-CoV-2'nin bir öncüsü köpeklerin bağırsaklarını istila ederse, hızlı virüs evrimine yol açacaktır. ", böylece CpG bölgesini kaybediyor ve insanları enfekte etmek için daha uygun hale geliyor. Çalışma, düşük CpG seviyesine ek olarak, SARS-CoV-2 ve köpek koronavirüsü arasında başka genetik benzerlikler fark etmedi, ancak köpek bağırsağının bu tür virüslerin evrimi için uygun bir ortam sağlayabileceği öne sürüldü.
Ama neden bir köpeğin bağırsakları? Xia, bazı çalışmaların, protein oluşturma talimatlarını içeren ZAP mRNA'nın köpeklerin akciğerlerinde ve kolonlarında göründüğünü, ancak akciğerlerde daha yüksek konsantrasyonlarda biriktiğini gösterdiğini söyledi. Xia, akciğerlerdeki aşırı ZAP'nin organları koronavirüs enfeksiyonundan koruduğunu, kolondaki düşük ZAP konsantrasyonlarının bağırsakları ciddi enfeksiyonlara duyarlı hale getirebileceğini, ancak bu sonucun daha ayrıntılı analiz gerektirdiğini söyledi.
Ancak bu varsayım mantıklı mı?
Çalışmaya dahil olmayan San Francisco Eyalet Üniversitesi'nde ekoloji ve evrim profesörü yardımcısı Pleuni Pennings, "Verilerin bu sonuçları desteklediğini sanmıyorum" dedi. Pennings'in araştırma ekibi birçok virüsün CpG seviyelerini test etti ve araştırma mantığındaki birkaç zayıf noktaya dikkat çekti.
Belirsiz kanıt
2018'de PLOS Genetics dergisinde yayınlanan bir çalışmada Pennings, HIV virüsündeki CpG seviyesini araştırdı ve patojenlerin bireyler içinde nasıl geliştiğine dair ilkeleri araştırdı. Daha sonra, bu virüslerin mutasyonlar yoluyla CpG sitelerini ne sıklıkla kaybettiğini veya kazandığını anlamak için diğer birkaç virüs (dang humması virüsü, grip, hepatit B ve hepatit C dahil) üzerinde benzer bir araştırma yaptı. Araştırma ekibi, genel olarak, CpG sitelerini artıran mutasyonların, CpG sitelerini genomdan silen mutasyonlardan ziyade insanlardan toplanan virüs örneklerinde görülme eğiliminde olduğunu buldu.
Mutasyona uğramış CpG'nin virüsler için maliyetli olabileceğine inanıyorlar çünkü insanlara vücutlarının enfekte olduğunu hatırlatıyorlar, bu nedenle zamanla evrim devam ettikçe görünümleri yavaş yavaş azalacak. Başka bir deyişle, birçok virüs hala CpG sitelerini taşıyor, bu nedenle mutasyonlar bazı faydalar sağlayabilir, ancak SARS-CoV-2 bu açıdan nadir değildir ve birçok virüs SARS-CoV-2'den daha düşük değerlere sahiptir. Şaşırtmayan bir şekilde.
Xia, SARS-CoV-2'nin diğer hayvan kaynaklı koronavirüslerden daha az CpG bölgesi içerdiğini tespit ederse, bu bulgunun doğru olduğunu varsayarak, bunun neden olduğu sorusunu gündeme getirdiğini ekledi. . Ancak SARS-CoV-2'nin neden CpG sitesini kaybettiğini açıklamak için evrimsel nedenler kullanılsa bile, bu evrimsel neden insanlara bulaşan virüse özel avantajlar getirmeyebilir.
Xia, SARS-CoV-2'deki CpG seviyesinin hastalığın ciddiyeti ile belirli bir ilişkisi varsa, bunun aşı geliştirme için etkili bir yol sağlayacağını söyledi. Bu varsayımsal durum altında, bilim adamları CpG bölgesini laboratuvar petri kabındaki koronavirüs genomundan çıkarabilir, böylece patojeni zayıflatabilir ve aşıya güvenli bir şekilde dahil edilmesini sağlayabilir. Ancak şu ana kadar, CpG ile SARS-CoV-2 enfeksiyonunun göreceli şiddeti arasında bir korelasyon yoktur.
Xia'nın çalışmasına dahil edilen bazı pangolin koronavirüsleri, SARS-CoV-2 ve yarasa virüsü RaTG13 ile karşılaştırılabilecek az sayıda CpG bölgesi de içeriyor. Xia, insanlar ve pangolin koronavirüsleri arasındaki diğer genetik farklılıkları göz önünde bulundurarak, bu düşük CpG pangolin koronavirüsü ile SARS-CoV-2 arasındaki ortak atanın 130 yıldan daha uzun bir süre önce var olabileceğini söyledi. Bu nedenle, SARS-CoV-2'nin öncü hücrelerinin daha yakın zamanda ortaya çıkmasını bekliyorlar.
Peki köpekler aralıklı bir koronavirüs konağı mı? Şu anda bunu gösterecek bir kanıt yok.
