Yeni kuronları tespit etmek 9 kat daha hızlıdır, CRISPR dönen floresan PCR
16 Nisan'da ABD saatine göre, Kaliforniya Üniversitesi, San Francisco ve Mammoth Biosciences'tan araştırmacılar, CRISPR-Cas12 tabanlı bir yan etki bildiren Nature Biotechnology'de "CRISPR-Cas12 tabanlı SARS-CoV-2 tespiti" başlıklı bir makale yayınladılar. Akış algılama teknolojisine doğru, nazofaringeal sürüntülerin RNA özlerinden SARS-CoV-2'yi algılayabilir. "hızlı( < 40 dakika), uygulaması kolay ve doğru. "
(Kaynak: Nature Biotechnology)
Makale, bu yöntemin% 95 pozitif tahmin oranı ve% 100 negatif tahmin oranı ile SARS-CoV-2 gerçek zamanlı RT-PCR belirlemesi için ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri için sezgisel ve hızlı bir alternatif yöntem sağladığını ortaya koymaktadır. Aynı zamanda, teknoloji özel ekipman gerektirmez ve Amerika Birleşik Devletleri'ndeki test birikimini kolaylaştırmaya yardımcı olabilir.
SciPhi, CRISPR alanında çalışan bir bilim insanı olan Jennifer Doudna'nın Mammoth Biosciences'ın danışma kurulu üyesi olduğunu keşfetti. Jennifer Doudna, Berkeley'deki California Üniversitesi'nde kimya ve moleküler biyoloji ve hücre biyolojisi profesörüdür ve CRISPR adlı bir gen düzenleme teknolojisinin rolünü keşfetmesiyle dünyaca ünlüdür.
Şekil Jennifer Doudna (Kaynak: Wikipedia)
Ribozimlerin temel yapısını ve işlevini ilk kez ortaya çıkaran oydu ve bu çalışma daha sonra CRISPR-Cas 9'u yaratmaya yardımcı olması için temel oluşturdu. Geliştirdiği CRISPR-Cas 9, bu aşamadaki en ucuz gen düzenleme aracıdır. Jennifer Doudna, CRISPR'ye yaptığı bilimsel katkılara ek olarak, insan embriyolarını CRISPR-Cas9 ile düzenlemenin etik önemi hakkında bir kamuoyu tartışmasına da öncülük etti.
Şu anda ABD Gıda ve İlaç Dairesi (FDA) bu denemeyi onaylamadı, ancak hızlı bir şekilde onay almak için klinik değerlendirmeden geçiyor.
Amerika Birleşik Devletleri'ndeki yeni taç salgını salgını, virüs tespit kitlerine olan talebi artırdı.ABD'deki yerel laboratuvarlar, virüs tespitini 4-6 saat içinde tamamlayabilen kantitatif RT-PCR (qRT-PCR) tespit yöntemlerine dayalı kitler geliştirdi. Teknolojiye Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri'nden (CDC) bir acil kullanım izni (EUA) verildi.
Bununla birlikte, örneklerin bir gece boyunca bir referans laboratuvara gönderilmesi gerektiğinden, SARS-CoV-2 şüphesi olan hastaların taranması ve teşhis edilmesi için geri dönüş süresi 24 saati aşmıştır. Tespit süresinin nispeten hızlı olmasına ve gerekli ekipmanın nispeten basit olmasına rağmen, kullanım, akut SARS-CoV-2 enfeksiyonunun teşhisi ile sınırlıdır ve uygulama kapsamı dardır.
Araştırma ekibi, nazofaringeal veya orofaringeal sürüntülerden RNA'yı çıkardı, in vitro olarak büyüttü ve SARS-CoV-2'nin tespitini sağlamak için önceden tanımlanmış koronavirüs dizisini tespit etmek için Cas12'yi kullandı.
Şekil Algılama prensibi (kaynak: yukarıdaki kağıt)
"Bu işlem, virüsün tespitini ve onayını yaklaşık 40 dakika içinde tamamlayarak ABD için çok önemli olan yavaş hız sorununun üstesinden gelebilir."
Bu yeni testin, yeni koronavirüsleri tespit etmek için CRISPR gen hedefleme teknolojisini kullanan ilk testlerden biri olduğunu belirtmekte fayda var.CRISPR herhangi bir gen dizisini hedefleyecek şekilde modifiye edilebilir. Çalışmanın ortak yazarı ve baş geliştiricisi ve UCFS'de laboratuvar tıbbı profesörü Charles Chiu, "Bu özellik, yeni nesil yeni koronavirüs tespit yöntemlerinin uygulanmasını hızlandıracak." Dedi.
CRISPR / Cas sistemi, ortaya çıkan bir gen yönelimli düzenleme teknolojisi olarak kademeli olarak olgunlaşır ve birçok hayvan ve bitki türünde başarıyla uygulanmıştır.Bakterilerde ve arkelerde yaygın olarak bulunur ve vücudun uzun vadeli evrimi tarafından yönlendirilir. İstilacı virüsü veya faj DNA'sını bozan uyarlanabilir bağışıklık sistemi. Ortaya çıkması, gen fonksiyon analizi ve insan hastalığı hedefli terapi gibi uygulamalarda büyük potansiyele ve geniş beklentilere sahip olan genetik mühendisliği için güçlü yeni bir uygulama aracı sağlar; araştırmalar, CRISPR / Cas sisteminin önemli mahsul pirincini hızlandırmasının beklendiğini göstermektedir. , Buğday özellik iyileştirme ve moleküler yönlü ıslah. Daha cesaret verici olan şey, basit işleminin, kısa deney döngüsünün ve maliyet tasarrufunun bu teknolojiyi sıradan laboratuvarlarda yaygınlaştırmak için yararlı olmasıdır.
14 Şubat gibi erken bir tarihte, Broad Institute of MIT ve Harvard University'nin çekirdek üyeleri Zhang Feng, Omar Abudayyeh ve Jonathan Gootenberg, arıtma için uygun RNA geliştirmek için CRISPR tabanlı SHERLOCK sistemini kullandılar. Bu, COVID-19'u klinik olarak tespit etmek için CRISPR tabanlı tanı yöntemlerinin geliştirilmesine yardımcı olabilir.
6 Nisan'da Zhang Feng'in ekibinin, RNA'yı saflaştırmak için SHERLOCK sistemini kullanan saflaştırma planı başarılı oldu ve saflaştırma işlemi 5 dakika içinde tamamlanabilir.
Şekil SHERLOCK sistem test sonuçlarının miktarının belirlenmesi (kaynak: COVID-19 için SHERLOCK araştırma protokolü)
8 Nisan'da, yukarıdakilere dayanarak, Zhang Feng'in ekibi, COVID-19 testinin ölçeğini önemli ölçüde genişletme potansiyeline sahip olan LAMP-Seq adlı bir teşhis yöntemi geliştirdi.Her gün milyonlarca örneğin analiz edilebilmesi bekleniyor.
Bu teknolojiler ve araştırma programları klinik tanı testleri tarafından onaylanmamasına rağmen. Bununla birlikte, CRISPR teknolojisinin olgun kullanımının yeni koronavirüs tespiti için yeni olanaklar getirebileceği kanıtlanmıştır.
