MS 5. yüzyıldan itibaren Slavlar batıya, şu anki Çek ve Slovak bölgelerine taşınmaya başladı. Bundan sonra, Batı Slav Kabile İttifakı, 10. yüzyılın ortalarında Macaristan Krallığı tarafından ilhak edilen ve yıkılan "Büyük Moravya İmparatorluğu" nu kurdu. 11. yüzyılın başında, merkezi Prag olan Çek Prensliği kuruldu ve bölgesi Bohemya'dan Moravya'ya kadar genişledi. 12. yüzyılın ikinci yarısında Çek Prensliği o zamanki Kutsal Roma İmparatorluğu'na teslim oldu ve Bohemya Krallığı olarak yeniden adlandırıldı. .
Sonraki yüzyıllarda Bohemya Krallığı, birbiri ardına Kutsal Roma İmparatorluğu'nun Habsburgları ve Avusturya Habsburgları'nın yönetimi altındaydı ve bu süre zarfında kısa bir bağımsızlık kazandı. 1620'de Çek Cumhuriyeti, Avusturya Habsburgları'nın bir eyaleti oldu. 1867'de ikili Avusturya-Macaristan İmparatorluğu kuruldu ve Çek Cumhuriyeti ve Slovakya Avusturya-Macaristan İmparatorluğu'nun egemenliği altındaydı. Bu süreçte, Çek Cumhuriyeti Avusturya'ya bağlı iken, doğrudan Slovakya'yı yöneten Macarlar .
Birinci Dünya Savaşında Çek Cumhuriyeti ve Slovakya, Avusturya-Macaristan İmparatorluğunun üyeleri olarak Doğu Cephesinde Rusyaya karşı sert bir şekilde savaştılar ve bu sırada bağımsızlık arayışını çoktan düşünmüşlerdi. 1918'de Avusturya-Macaristan İmparatorluğu yenildi ve zaten çökmekte olan devasa imparatorluk parçalandı. O yılın Ekim ayında, Müttefik Güçlerin işbirliği ile Çekoslovak Cumhuriyeti kuruldu.
İki etnik grubun kültürleri, dilleri ve inançları benzer olsa da, aşikar coğrafi sınırlar bunun gerçekten ulaşmak istedikleri "bağımsızlık" olmadığını belirler. Bu Çeklerin hakim olduğu bir ülke kurulduktan sonra, Slovaklar, Slovakya'nın yalnızca ülkenin bir bölgesi olduğunu ve gerçek bir siyasi egemenliğe sahip olmadığını düşünerek kendilerini eşitsiz hissediyorlardı. .
Uzun vadeli boyun eğme duygusu, Slovakları bağımsız olarak "kendi ülkesine" sahip olma konusunda son derece hevesli hale getiriyor. 1939'da, II.Dünya Savaşı'nın başlamasından önce Almanya, Çekoslovakya'nın tamamını işgal etmek için birlikler gönderdi. 15 Mart'ta Hitler, şahsen Bohemya ve Moravya Koruyuculuğu ile Slovak Devleti'nin parçalanmış Çekoslovak topraklarında kurulduğunu ilan etti. Slovakların "bağımsız bir devlet" hayali gerçekleşti, ancak bu sadece kısa ömürlü bir kukla rejim.
II.Dünya Savaşı'ndan sonra yüzlerce isteksizlik olsa bile Slovaklar Çeklerle yaşamak zorunda kaldı. Churchill, 1946'da, trajik hayatın "perde arkasındaki" bir dizi ülkeyi listeleyen ve sonunda "Çekoslovakya hariç" vurgusunu yapan ünlü Demir Perde konuşmasını yaptı. Öyle olsa bile, Çekoslovakya hâlâ çok kızgın, özellikle Orta Avrupa'nın çekirdek bölgesinde yer alan Çek Cumhuriyeti, neden "Doğu kampına bölündüğünü" gerçekten anlayamıyor. .
1968'de, "Prag Baharı" Sovyetler Birliği önderliğindeki Varşova Paktı tarafından temizlendi ve Çekoslovakya sona erdi. Yirmi yıl sonra, 1989'da Çekoslovakya "Kadife Devrimi" ni başlattı. Çek Cumhuriyeti ile Slovakya arasındaki ayrılık eğilimi giderek daha açık hale geliyor ve aralarında en acil olanları Slovaklar.
Slovaklar, önce ülke adına "Çek Slovak Cumhuriyeti" nin "Çek-Slovakya" ile değiştirilmesini savundular ve daha sonra bunu "Çek ve Slovak Federal Cumhuriyeti" olarak değiştirdiler ve son olarak Kasım 1992'de "Çek ve Slovak Federal Cumhuriyeti'nin Feshine İlişkin Kanun" istendiği gibi kabul edildi.
Slovakya, 1 Ocak 1993'te resmen bağımsızlığını kazandı ve sonunda "bağımsız bir ülke" hayalini gerçekleştirdi. Aynı anda parçalanan Sovyetler Birliği ve Yugoslavya'dan farklı olarak, Çekoslovakya'nın dağılması klasik bir "birleşim ve dağılma" olarak görülebilir ve bu durum, iki barışçıl ulusun hiçbir tarihsel sıkıntıya sahip olmamasından kaynaklanıyor olabilir.
O dönemde tek bölümden oluşan Çekoslovakya milli marşı şimdi ikiye bölünerek Çek ve Slovak milli marşları oldu. 2006 yılı Hem Çek Cumhuriyeti hem de Slovakya, Dünya Bankası tarafından gelişmiş ülkeler sıralamasına dahil edilmiştir. Artık iki ülke, zengin bir hayat yaşamak için birlikte çalışan hem AB hem de NATO üyesi ülkelerdir. .