Yeni araştırma: kaplumbağalar yeni koronavirüs için potansiyel ara konakçılar da olabilir
Daha önce, araştırmacılar yeni koronavirüsün yarasalarının veya doğal konaklarının, yılanların ve pangolinlerin potansiyel ara konakçılar olabileceğini öne sürmüşlerdi.
26 Şubat'ta, Hubei Tıp Fakültesi Halk Hastanesinden Liu Long ve Guangzhou'daki Jinan Üniversitesi'nden Wu Jianguo'nun araştırma ekibi, Journal of Medical Virology'de kaplumbağaların (batı boyalı kaplumbağa, yeşil deniz kaplumbağası, Çin yumuşak kabuklu kaplumbağa) olabileceğini belirten bir makale yayınladı. Yeni koronavirüsün insanlara yayılması için potansiyel ara konakçı.
En son araştırma, SARS-CoV-2'nin potansiyel ara konağını tahmin etmek için koronavirüs spike proteini ve konakçı ACE2 reseptörünün bileşimini ve farklılığını kullanıyor.
Bu çalışmanın odak noktası, SARS CoV-2 ve SARS-CoV, yarasa SARS benzeri CoV ve diğer koronavirüsler arasındaki diken dizilerini karşılaştırmaktır. Bu, evrimsel analizi ve olası virüs kitaplıklarını araştırmayı kolaylaştırır. Ek olarak, ACE2 yapısının analizi ve bağlanma motifi hizalaması, potansiyel konakçıları ayırt etmek için ipuçları sağlamaya yardımcı olabilir.
SARS-CoV-2, 15 yapısal olmayan protein, 4 yapısal protein ve 8 yardımcı protein dahil en az 27 proteini kodlar. Spike proteini (S), virionun dış kabuğunda bulunan yapısal bir proteindir ve konak reseptör anjiyotensin dönüştürücü enzim 2'ye (ACE2) bağlanmaktan sorumludur. Spike proteinindeki reseptör bağlanma bölgesi (RBD) dizisinin evrimsel ilişkisinin incelenmesi, virüs köken eğiliminin anlaşılmasına yardımcı olur.
Çalışmanın sonuçları, yarasa SARS benzeri CoV RaTG13'ün SARS-CoV-2 genel genomu ile% 96,2 sekans özdeşliğine sahip olduğunu gösterdi. SARS-CoV'nin pangolin örneklerinde en yaygın olarak dağıtılan koronavirüs olduğunu belirtmek gerekir.
Spike RBD reseptör etkileşimi, koronavirüslerin konakçı aralığını belirlemede kilit bir faktördür. Araştırma ekibi, SARS-CoV, yarasa veya pangolin SARS benzeri CoV ve SARS-CoV-2'den elde edilen başak proteinlerinin RBD dizilerini karşılaştırdı.
Yarasa SARS benzeri CoV 473'ten 490. kalıntılara kadar eksiktir ve dış alt etki alanında bulunur Bu virüslerin doğal olarak insanlara bulaşmayacağı kesin gibi görünüyor. Şu anda yarasa SARS benzeri CoV'nin insanlara bulaştığına dair doğrudan bir kanıt yok.
Pangolin SARS benzeri CoV SRR10168377, yarasa SARS benzeri CoV RaTG13 ile sadece% 85 aynıdır. Bu, sadece diken RBD'ye odaklanırsa, pangolin SARS benzeri CoV SRR10168377'nin konak bariyerini geçebileceğini ve insanları enfekte edebileceğini gösterir.
SARS-CoV'nin insan ACE2'ye bağlanmasına benzer şekilde, reseptör üzerindeki 31, 41, 82, 353, 355 ve 357 kalıntıları, SARS CoV-2 diken proteini ile etkileşime girdiğinde yüzeye lokalize edilecektir.
ACE2 reseptörleri 41 ve 353 ile RBD alanındaki Asn501 perspektifinden bakıldığında, kaplumbağalar ve pangolinler insanlara yarasalardan daha yakın görünmektedir. Bu, kaplumbağaların ve pangolinlerin SARS-CoV-2 için potansiyel genişleme konakları olabileceğini gösterir.
Yapısal kombinasyon mekanizmasını anlamak, doğru bir virüs kitaplığı bulmaya ve önleyici karşı önlemlerin formüle edilmesine yardımcı olacaktır. SARS-CoV-2 spike protein kristallerinin kriyo-elektron mikroskobu ile acil analizi, SARS CoV-2 spike RBD ile insan ACE2 veya diğer konak reseptörleri arasındaki etkileşimin bağlanma noktasının doğrulanmasına yardımcı olur.
Raporlara göre, SARS-CoV-2 spike proteininin ACE2'ye bağlanma yeteneği, SARS-CoV'den çok daha güçlüdür. Bu, SARS-CoV-2 için daha fazla ara ana bilgisayar olduğunu gösterir.
Şu anda, kaplumbağalar gökkuşağı kurbağa virüsü (RV), Nido virüsü (NV), papilloma virüsü (PV), kaplumbağa yanardöner virüsü (STIV) ve kaplumbağa sistemik sepsis küresel virüsü dahil düzinelerce virüs taşıyan bir virüs kitaplığı olarak biliniyor. (STSSSV), kaplumbağa pikornavirüsü (ToPV) ve Çin kaplumbağa hemorajik sendrom virüsü (TSHSV). Yarasa SARS benzeri CoV RaTG13 veya diğer SARS benzeri CoV'nin kaplumbağalara bulaştığı ve evrimden sonra insanlara yayıldığı göz ardı edilemez.
SARS-CoV ve MERS-CoV'den SARS-CoV-2'ye yarasalar, koronavirüslerin doğal konakçılarıdır, ancak ara konaklar farklıdır. Önceki çalışmalar, diğer hayvanlarla karşılaştırıldığında yılanların, eş anlamlı kodon kullanımı (RSCU) önyargıları nedeniyle, SARS-CoV-2'nin vahşi hayvan virüsü havuzu olma ihtimalinin yüksek olduğunu göstermiştir.
Zoonotik hastalıkların ara konakçıları olan misk kedileri ve tek hörgüçlü develer SARS-CoV ve MERS-CoV farklı zaman ve uzay ortamlarında yaşarlar, ancak yine de insanlara koronavirüsü bulaştırırlar. Bu, kısa vadede SARS-CoV-2 için bir ara konak bulmayı zorlaştırır.
Viral reseptör bağlanma dizisinin ve konak reseptörünün analizi, SARS-CoV-2 olası ara konakçıların hızla hedeflenmesine yardımcı olur. Yasadışı ticareti yapılan pangolinler ile karşılaştırıldığında, piyasadaki kaplumbağalar daha genel olarak popülerdir.
Kısaca, çalışma yılanlar ve pangolinler gibi kaplumbağaların (batı boyalı kaplumbağalar, yeşil kaplumbağalar ve Çin yumuşak kabuklu kaplumbağalar) da SARS-CoV-2'nin insanlara yayılması için potansiyel ara konakçılar olabileceği konusunda bazı bilgiler sağlamaktadır, ancak daha ileri adımlar gereklidir. Doğrulamak için araştırma yapın.
(Kağıt)
Muhabirler bulun, raporlar isteyin, yardım isteyin, büyük uygulama pazarlarında "Qilu One Point" APP'yi indirin veya WeChat uygulaması "One Point Intelligence Station" üzerinde arama yapın. Eyaletteki 600'den fazla ana akım medya muhabiri çevrimiçi rapor vermenizi bekliyor! Rapor etmek istiyorum
