Yeni koronavirüs mutasyona uğradı ve iki alt tipe dönüştü. Etkisi ne kadar büyük?
İçbükey tapınaktan on üç Qubit Raporu | Genel Hesap QbitAI
Yeni koronavirüs mutasyona uğradı ve iki alt türe evrildi.
Bu çalışma, 103 yeni koronavirüs tüm genom molekülünün (şimdiye kadarki en büyük ölçek) evrimini analiz etti ve virüs türünün meydana geldiğini buldu. 149 mutasyon noktası , Ve çoğu yakın zamanda üretildi.
Çalışma ayrıca yeni koronavirüsün geliştiğine de işaret etti. İki alt tip L ve S . Oran açısından, L alt tipinin% 70'e ulaşması daha yaygındır ve S alt tipi% 30'dur. Bunlar arasında, L alt tipi daha agresif ve bulaşıcı olabilir.
Bu araştırma bir süre herkesin dikkatinin odağı haline geldi ve Zhihu Hot List'te üçüncü sıraya yükseldi ve 29.66 milyona ulaştı.
Bu, Çin bilimsel araştırma ekibinden ve 3'te National Science Review'da yayınlandı.
Peki neler oluyor? Salgını daha da kötüleştirecek mi?
Virüs 2 alt türe evrildi, L alt tipi daha bulaşıcı olabilir
Bu çalışma için toplam 103 viral genom dizisi seçildi ve kaynaklar GISAID ve GenBank'tır.
Viral genomların daha fazla analizinden sonra, 43 eşanlamlı mutasyon ve 83 eşanlamlı olmayan mutasyon dahil olmak üzere 149 mutasyon bölgesi bulundu.
Çalışma, virüs dizisinin% 70'inin 7 özdeş duyu mutasyonuna ve ayrıca 6 virüs proteininin işlevini etkileyen 1 özdeş yanlış mutasyona (L84S) sahip olduğunu buldu.
Çalışma, bu mutasyonlara sahip virüslerin% 70'ini SARS-CoV-2 olarak sınıflandırdı. L alt türü (L, yanlış anlamlı mutasyon L84S'den türetilmiştir); S84L ise S alt türü .
Daha sonraki araştırma ve analizler, iki alt tipin doğal döngüsel rekombinasyona uğramadığını gösterdi; SNP analizi ayrıca bu soyağacı sınıflandırmasını doğruladı, 72 virüs dizisi L'yi kodlayan T28144 idi; 29 virüs dizisi S kodlayan C28144 idi. L tipi bir T tabanıdır (Leu, Leu'ya karşılık gelir) ve S tipi bir C tabanıdır (Serine, Ser'e karşılık gelir).
Araştırmacılar, L tipi ve S tipi suşlar arasındaki ilişkiyi daha fazla incelemek için, 103 SARS-CoV-2 virüs genom dizisini, Evrim ağacı (filogenetik ağaç).
Bu analiz, bu iki alt tip arasındaki farkı daha da doğruladı.
SARS-CoV ailesinde, diğer önceki virüslerin dizilerinin tümü S84L'dir. Bu nedenle çalışmalar, şu anda popüler olan L alt tipinin S alt tipinden evrimleştiğine ve S alt tipinin aslında L alt tipinin "atası" olduğuna inanmaktadır.
Bir başka ilginç bulgu da, iki virüs türü arasında zaman ve mekan farklılıkları olmasıdır.
Wuhan'daki 27 virüs sekansı arasında 26'sı L alt tipi ve sadece 1'i S alt tipidir. Wuhan dışındaki 73 virüs sekansı (33 yerli ve 40 yabancı) arasında 45'i L tipi ve 28'i S tipiydi.
Ek olarak, 7 Ocak'tan önce, L alt türleri büyük çoğunluğu oluşturuyordu. Ancak sıralama süresi gerçek enfeksiyon süresi değildir, bu nedenle zamanlaması tahmin edilemez.
Wuhan'daki salgının erken aşamalarında L alt tipi daha yaygındır ve L alt tipinin sıklığı 2020 Ocak ayının başlarından sonra azalmıştır.
Yazar, insan müdahalesinin L alt tipi üzerinde daha fazla seçici baskı uygulayabileceğine inanmaktadır.Bu müdahaleler olmadan, L alt tipi daha agresif olabilir ve daha hızlı yayılabilir.
Toplamda, bu çalışma 103 SARS-CoV-2 genom analizini geçti, İlk kez, popülasyon aktarımı sürecinde virüslerin evrimini sistematik olarak açıkladı .
Mutasyon, virüsü L tipi ve S tipi olarak ikiye ayırır.Virüs salgınının erken safhasında L tipi baskındır.Tıbbi tedavi ve izolasyon önlemleri gibi insan müdahaleleri güçlendikten sonra, seçim baskısındaki değişim L tipi baskınlıktan S tipi baskınlığa doğru değişir.
Sürekli gelişen bu tip, tıbbi kurumların odaklanmasını gerektirebilir.
Virüs mutasyonunun etkisi nedir?
Peki, virüs mutasyona uğradıysa, salgını daha da kötüleştirecek mi?
Zhihu netizen "Leng Zhe" bu konuda yorum yaptı, diye düşündü:
Virüsün doğal mutasyonu kaçınılmaz ... Şu anda çok az mutasyon var ve rekombinasyon olmadı.Salgını etkilemedi ve salgın ciddileşmedi.Aynı zamanda mevcut mutasyonlar mevcut aşıların gelişimini etkilemeyecek.
Aynı zamanda bu retrospektif bir çalışmadır Virüs zaten mutasyona uğramış değil, mutasyona uğramıştır.
Virüsler doğal olarak daha bulaşıcı ve öldürücü türler geliştirmiş olsalar da, bu son derece öldürücü virüsler tercihen yapay müdahale altında kontrol edilmektedir, bu nedenle artık daha az toksik türler yayılmaktadır.
Bazı netizenler bu çalışmanın tanımlayıcı bir analiz olduğuna inanıyor, yani Çıkarım tamamen gözleme dayanmaktadır , Toksikolojik analiz değil.
Araştırmanın odak noktası virüsün kökenidir ve daha yararlı bilgi noktaları "virüs mutasyona uğramıştır", "iki alt tip vardır" ve "zaman ve mekanda farklılıklar vardır".
Diğer çıkarımlara gelince, daha fazla analize ihtiyaç vardır.
Ünlü sağlık blog yazarı ve tıp doktoru "Ziling şarkıyı dinliyor" da benzer görüşleri dile getirdi ve inanıyor:
Bunun sadece bir biyoinformatik çalışması olduğu, bir laboratuvar çalışması olmadığı ve sonuçların öznel olduğu vurgulanmalıdır.
Bu analiz, MUSCLE gibi bazı yazılımlar kullanılarak kendi başımıza yapılabilir.
Araştırma ekibi tanıtımı
Lu Jian, Pekin Üniversitesi Yaşam Bilimleri Fakültesi'nde araştırmacı ve doktora süpervizörüdür.
Ana araştırma yönleri, kodlamayan RNA'nın kökenini ve evrimini ve yeni kodlamayan RNA genlerinin evrimini yönlendiren mekanizmaları içerir; transkripsiyon seviyesi düzenlemesiyle ilgili fonksiyonel genomikler vb.
Cui Jie, Çin Bilimler Akademisi Şangay Pasteur Enstitüsü'nde, Çin Bilimler Akademisi Yüz Yetenek Programında araştırmacı, doktora danışmanı ve patojenik biyoinformatik araştırma grubunun lideridir.
Araştırma yönü, patojen oluşumu, patojen ve konakçı birlikte evrimi; omiklere dayalı kanser büyük veri analizi, kanser genomiği; ve biyoinformatiğe dayalı patojen ilişki analizi üzerine odaklanmaktadır.
Bir şey daha
Bu araştırma sadece çıkarımsal bir sonuç olsa da, son zamanlarda nispeten önemli bir haber daha çıktı.
Hong Kong'da bir köpeğe dünyadaki ilk vaka olan yeni koronavirüs teşhisi kondu!
Sahibi yeni koroner pnömoni teşhisi konmuş bir kişidir Köpek, Hong Kong Tarım, Balıkçılık ve Koruma Departmanı tarafından virüs için iki kez test edildi ve ağız ve burun boşluğu örneklerinin zayıf bir şekilde pozitif olduğunu buldu.
Ve daha dün, Hong Kong Balıkçılık ve Koruma Departmanı, sonuçların köpeğin virüse düşük düzeyde bulaştığını göstererek onu dünyadaki ilk vaka haline getirdiğini söyledi.
Mevcut genel eğilim Çin'de salgının hafifletildiğine dair işaretler gösterse de, onu hafife almamalıyız ve "salgının önlenmesinin kalbi" gevşememelidir!
Portal
Kağıt adresi: https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463
Referans bağlantısı:
https://www.zhihu.com/question/376680418
https://www.weibo.com/529645621?profile_ftype=1is_all=1#1583375175321
- Bitiş -
Qubit QbitAI · Toutiao İmzalı
Bize dikkat edin ve en son teknolojideki en son gelişmeleri alın
